Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfdp1O88271 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms