Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stra6O70491 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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