Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms