Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms