Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zmat3O54836 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Zmat3O54836 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zmat3O54836 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms