Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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DffaO54786 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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DffaO54786 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DffaO54786 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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