Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms