Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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