Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3278L7N2D2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms