Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms