Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8888J3QPX5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms