Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms