Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim22J3QP37 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms