Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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