Protein–RNA interactions for Protein: J3QN05

Gm21834, Predicted gene, 21834, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21834J3QN05 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21834J3QN05 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21834J3QN05 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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