Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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