Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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