Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms