Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm20828J3KMI7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm20828J3KMI7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm20828J3KMI7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm20828J3KMI7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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