Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn20G5E8X0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn20G5E8X0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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