Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms