Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf148G3X9R7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms