Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms