Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms