Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms