Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Rnf217D3YYI7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Rnf217D3YYI7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rnf217D3YYI7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms