Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms