Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp26c1B2RXA7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms