Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms