Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms