Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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PtprsB0V2N1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PtprsB0V2N1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PtprsB0V2N1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms