Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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