Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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