Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Rtf1A2AQ19 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Rtf1A2AQ19 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms