Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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