Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms