Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms