Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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