Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms