Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms