Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms