Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms