Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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