Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms