Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek4Q9Z1J2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms