Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms