Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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