Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms