Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms