Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms